MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis CTRI-2 chromosome

Total Repeats: 100120

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017524	CAC	2	6	27	32	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996773
2	NC_017524	GTC	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996773
3	NC_017524	GAC	2	6	79	84	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
4	NC_017524	CAG	2	6	90	95	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
5	NC_017524	TCG	2	6	167	172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996773
6	NC_017524	AGC	2	6	199	204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
7	NC_017524	GCC	2	6	260	265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996773
8	NC_017524	CCG	2	6	304	309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996773
9	NC_017524	CGAC	2	8	311	318	25 %	0 %	25 %	50 %	385996773
10	NC_017524	CGA	2	6	324	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
11	NC_017524	GCC	2	6	339	344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996773
12	NC_017524	ACG	2	6	389	394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
13	NC_017524	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996773
14	NC_017524	CGTT	2	8	527	534	0 %	50 %	25 %	25 %	385996773
15	NC_017524	CGC	3	9	561	569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996773
16	NC_017524	CCCG	2	8	589	596	0 %	0 %	25 %	75 %	385996773
17	NC_017524	AC	3	6	643	648	50 %	0 %	0 %	50 %	385996773
18	NC_017524	GGCA	2	8	660	667	25 %	0 %	50 %	25 %	385996773
19	NC_017524	GTT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996773
20	NC_017524	CGA	2	6	810	815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
21	NC_017524	TTC	2	6	856	861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996773
22	NC_017524	CAA	2	6	888	893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996773
23	NC_017524	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	385996773
24	NC_017524	CCCA	2	8	918	925	25 %	0 %	0 %	75 %	385996773
25	NC_017524	AGC	2	6	926	931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
26	NC_017524	ACC	2	6	993	998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996773
27	NC_017524	CGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
28	NC_017524	CAG	2	6	1086	1091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996773
29	NC_017524	GC	3	6	1121	1126	0 %	0 %	50 %	50 %	385996773
30	NC_017524	GCG	2	6	1237	1242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996773
31	NC_017524	CCG	2	6	1259	1264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996773
32	NC_017524	CA	3	6	1408	1413	50 %	0 %	0 %	50 %	385996773
33	NC_017524	CAC	2	6	1491	1496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996773
34	NC_017524	CGTTT	2	10	2092	2101	0 %	60 %	20 %	20 %	385996774
35	NC_017524	GTGG	2	8	2132	2139	0 %	25 %	75 %	0 %	385996774
36	NC_017524	GCCA	2	8	2150	2157	25 %	0 %	25 %	50 %	385996774
37	NC_017524	CGGTGC	2	12	2164	2175	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385996774
38	NC_017524	GTT	2	6	2186	2191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996774
39	NC_017524	CCG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996774
40	NC_017524	TTG	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996774
41	NC_017524	CGA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996774
42	NC_017524	TTG	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996774
43	NC_017524	ATT	2	6	2477	2482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385996774
44	NC_017524	TCAG	2	8	2494	2501	25 %	25 %	25 %	25 %	385996774
45	NC_017524	CGC	2	6	2510	2515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996774
46	NC_017524	GAC	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996774
47	NC_017524	GGT	2	6	2576	2581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996774
48	NC_017524	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996774
49	NC_017524	GCC	2	6	2691	2696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996774
50	NC_017524	CGG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996774
51	NC_017524	CGTT	2	8	2720	2727	0 %	50 %	25 %	25 %	385996774
52	NC_017524	GCA	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996774
53	NC_017524	CTT	2	6	2808	2813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385996774
54	NC_017524	AC	3	6	2855	2860	50 %	0 %	0 %	50 %	385996774
55	NC_017524	CCA	2	6	2869	2874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996774
56	NC_017524	GC	3	6	2932	2937	0 %	0 %	50 %	50 %	385996774
57	NC_017524	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996774
58	NC_017524	TTG	3	9	3016	3024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996774
59	NC_017524	ACGG	2	8	3072	3079	25 %	0 %	50 %	25 %	385996774
60	NC_017524	GCCT	2	8	3134	3141	0 %	25 %	25 %	50 %	385996774
61	NC_017524	CGG	2	6	3205	3210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996774
62	NC_017524	CGGTT	2	10	3241	3250	0 %	40 %	40 %	20 %	385996774
63	NC_017524	CGTC	2	8	3285	3292	0 %	25 %	25 %	50 %	385996775
64	NC_017524	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996775
65	NC_017524	CGA	2	6	3416	3421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996775
66	NC_017524	GGTA	2	8	3465	3472	25 %	25 %	50 %	0 %	385996775
67	NC_017524	GTG	2	6	3499	3504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996775
68	NC_017524	ACG	2	6	3506	3511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996775
69	NC_017524	CAA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996775
70	NC_017524	ATC	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996775
71	NC_017524	TGT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996775
72	NC_017524	GGTT	2	8	3647	3654	0 %	50 %	50 %	0 %	385996775
73	NC_017524	CGG	2	6	3673	3678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996775
74	NC_017524	GAT	2	6	3688	3693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385996775
75	NC_017524	GT	3	6	3812	3817	0 %	50 %	50 %	0 %	385996775
76	NC_017524	TGG	2	6	3869	3874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996775
77	NC_017524	CCGC	2	8	3875	3882	0 %	0 %	25 %	75 %	385996775
78	NC_017524	GAA	2	6	3915	3920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996775
79	NC_017524	AGC	2	6	4029	4034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996775
80	NC_017524	GGC	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996775
81	NC_017524	GGC	2	6	4053	4058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996775
82	NC_017524	GAC	2	6	4111	4116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996775
83	NC_017524	GGC	2	6	4200	4205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996775
84	NC_017524	TGG	2	6	4227	4232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996775
85	NC_017524	GTT	2	6	4242	4247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385996775
86	NC_017524	CGA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996775
87	NC_017524	CGG	2	6	4301	4306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996775
88	NC_017524	CCG	2	6	4313	4318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996775
89	NC_017524	CCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996775
90	NC_017524	GGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996775
91	NC_017524	TGC	3	9	4532	4540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996776
92	NC_017524	CG	5	10	4542	4551	0 %	0 %	50 %	50 %	385996776
93	NC_017524	GTCGG	2	10	4589	4598	0 %	20 %	60 %	20 %	385996776
94	NC_017524	CGA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996776
95	NC_017524	GGT	2	6	4745	4750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996776
96	NC_017524	CCA	2	6	4754	4759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996776
97	NC_017524	ACG	2	6	4792	4797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996776
98	NC_017524	CGC	2	6	4877	4882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996776
99	NC_017524	CGG	2	6	4927	4932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996776
100	NC_017524	CG	3	6	4978	4983	0 %	0 %	50 %	50 %	385996776
101	NC_017524	AGA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996777
102	NC_017524	GTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
103	NC_017524	GCG	2	6	5191	5196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996777
104	NC_017524	GAG	2	6	5222	5227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996777
105	NC_017524	AAG	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996777
106	NC_017524	GGT	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
107	NC_017524	CGA	2	6	5401	5406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996777
108	NC_017524	TGC	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996777
109	NC_017524	CGA	2	6	5473	5478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996777
110	NC_017524	CCAC	2	8	5499	5506	25 %	0 %	0 %	75 %	385996777
111	NC_017524	ACCG	2	8	5518	5525	25 %	0 %	25 %	50 %	385996777
112	NC_017524	GTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
113	NC_017524	CGG	2	6	5554	5559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996777
114	NC_017524	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
115	NC_017524	CGGCGT	2	12	5602	5613	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385996777
116	NC_017524	GGT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
117	NC_017524	CAAG	2	8	5713	5720	50 %	0 %	25 %	25 %	385996777
118	NC_017524	AAG	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385996777
119	NC_017524	CGCC	2	8	5809	5816	0 %	0 %	25 %	75 %	385996777
120	NC_017524	CAA	2	6	5839	5844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385996777
121	NC_017524	CGA	2	6	5866	5871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996777
122	NC_017524	GTC	2	6	5891	5896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996777
123	NC_017524	TGG	2	6	6009	6014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
124	NC_017524	AGC	2	6	6056	6061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996777
125	NC_017524	GGC	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996777
126	NC_017524	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	385996777
127	NC_017524	GGT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385996777
128	NC_017524	AAGGAC	2	12	6254	6265	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385996777
129	NC_017524	AGACCA	2	12	6348	6359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385996777
130	NC_017524	GCG	2	6	6520	6525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996777
131	NC_017524	CGGC	2	8	6624	6631	0 %	0 %	50 %	50 %	385996777
132	NC_017524	ATC	2	6	6692	6697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996777
133	NC_017524	GC	3	6	6710	6715	0 %	0 %	50 %	50 %	385996777
134	NC_017524	ATC	2	6	6752	6757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385996777
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156	NC_017524	ACC	2	6	7552	7557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996778
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248	NC_017524	GAG	2	6	12210	12215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385996780
249	NC_017524	CTCA	2	8	12303	12310	25 %	25 %	0 %	50 %	385996780
250	NC_017524	ACG	2	6	12664	12669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996781
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255	NC_017524	CAG	2	6	13223	13228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385996782
256	NC_017524	C	6	6	13229	13234	0 %	0 %	0 %	100 %	385996782
257	NC_017524	GGC	2	6	13267	13272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385996782
258	NC_017524	TCG	2	6	13287	13292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996782
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260	NC_017524	AACC	2	8	13338	13345	50 %	0 %	0 %	50 %	385996782
261	NC_017524	GC	3	6	13389	13394	0 %	0 %	50 %	50 %	385996782
262	NC_017524	CCCG	2	8	13447	13454	0 %	0 %	25 %	75 %	385996782
263	NC_017524	TGC	2	6	13551	13556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385996782
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269	NC_017524	GA	3	6	14126	14131	50 %	0 %	50 %	0 %	385996784
270	NC_017524	TGAT	2	8	14135	14142	25 %	50 %	25 %	0 %	385996784
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288	NC_017524	CGC	3	9	14700	14708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996784
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293	NC_017524	ACC	2	6	15014	15019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385996785
294	NC_017524	GCC	2	6	15034	15039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385996785
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